Príbeh filmu sa začína zvláštnym, až nadpozemským momentom, keď počas letnej búrky na horskej ceste mladý umelec James Sunderland stretáva svoju osudovú Mary Crane. O chvíľu sa však z tohto opojného sna – romantizovanej spomienky na rozbitý život – prebudí na podlahe miestneho baru. Po menšom rozruchu ho vyhodia a hneď nato mu volá jeho znepokojená terapeutka. Odporučí mu oddych, ale James má iné plány. Neskôr v ateliéri, zlomený žiaľom a alkoholom, nachádza pod dverami ručne písaný lístok: Mary ho prosí, aby sa vrátil do miesta, ktoré kedysi nazývali domovom – Silent Hill. Niečo sa stalo. James neváha a vyráža. Vstupný tunel do mesta je zapečatený, no on pokračuje pešo cez lesný chodník a cintorín, zatiaľ čo z oblohy padajú popolavé vločky. Tak sa začína jeho zostup do prázdneho, postapokalyptického pekla – do labyrintu vlastnej mysle aj veľmi skutočnej nočnej mory. Na ceste za milovanou Mary sa mu postupne zjavujú desivé stvorenia Silent Hillu – Armless, Pyramid Head a ďalší.